1981 yılında 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu'nun 58. maddesiyle "Araştırma Fonu" olarak hayata geçen ve 2001 yılında 4684 sayılı kanunla "Bilimsel Araştırma Projeleri (BAP)"ne dönüştürülen BAP Koordinasyon Birimi; Mustafa Kemal Üniversitesi bünyesinde yer alan tüm Fakülte, Yüksekokul ve Enstitülerin yürütmekte olduğu bilimsel araştırma ve geliştirme projelerini koordine etmektedir.
"Bilimsel Araştırma Projeleriyle ilgili Yönetmelik" 10 Nisan 2002'de Resmi Gazetede yayımlanarak yürürlüğe girmiş ve 26 Kasım 2016 yılında yeni Yönetmelik yayınlanmıştır.
Üniversitemiz Bilimsel Araştırma Projeleri Komisyonu, Komisyon Başkanı Rektör Yardımcımız, 10 Komisyon Üyesi ve Raportörden oluşmaktadır. Üniversitemiz Rektörlük binasında bulunan Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü Birimimiz kurum içi ve kurum dışı yürütülen projelerin tüm işlemleriyle ilgilenmektedir.
BAP Koordinatörlüğü Gelirleri ;
-Döner Sermaye İşletmelerinden aktarılan tutarlar,
-BAP projelerinden elde edilen gelirler,
-BAP projeleri için yapılan bağış ve yardımlar,
-Yurt içi ve yurt dışı kuruluşlarla yapılan ortak araştırmalardan gelen tutarlar şeklinde ifade edebiliriz. Bilimsel Araştırma Projelerinin finansmanında kullanılan gelirler Maliye Bakanlığı'nca Üniversite bütçesine özel gelir ve açılacak tertiplere de özel ödenek olarak kaydettirilmek suretiyle kullanılmaktadır. Önceleri yıl içinde harcanamayan kısım Maliye Bakanlığına geri dönerken, Bugün BAP ödeneklerinin yıl içinde harcanmayan kısmı ertesi yılın bütçesine devren gelir ve ödenek kaydedilmektedir.
Gelir fazlası ödeneklerin kullanılması ve harcama kalemlerinin açılıp kapanması 2009 yılından itibaren serbest ve yıl boyunca Strateji Gelişme Daire Başkanlığı uygun olduğu sürece ödemelerin yapılabilmesi ve 2010 yılından beri de harcama kalemlerindeki miktarların ihtiyaçlar doğrultusunda harcama imkanı sağlanmıştır. Ayrıca BAP Koordinatörlüğü satın alma faaliyetlerinde diğer idareler için her yıl açıklanan limitin 3 kat fazla harcama yapabilmektedir.
2547 Sayılı Kanun'un değişik 58.maddesi gereğince, Mustafa Kemal Üniversitesi Senatosunca 23 Şubat 2005 tarih ve 03/2-3 toplantı karar sayılı
18 Haziran 2009 tarih ve 10/20 toplantı karar sayılı
03 Mayıs 2017 tarih ve 09/02 toplantı karar sayılı
22 Ekim 2020 tarih ve 33/01 toplantı karar sayılı
kabul edilen "BAP Koordinasyon Birimi Proje Teklifi Hazırlama ve Değerlendirme Yönergesi"
hükümlerine göre idaremizce iş ve işlemler yürütülmektedir. "Bilim İnsanı Portalı ve Bilimsel Araştırma Projeleri (E-BAP) Otomasyonu" Üniversitemizde oluşturulmuş ve 01 Haziran 2012 tarihinden itibaren araştırıcılarımız 365 gün ve 24 saat çevrimiçi (Online) olarak proje başvuru yapabilmektedirler. Böylece projelerin çok hızlı değerlendirilmesi mümkün olmaktadır.